MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011988	TC	3	6	148567	148572	0 %	50 %	0 %	50 %	222106254
2502	NC_011988	TGT	2	6	148576	148581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106254
2503	NC_011988	TTG	2	6	148587	148592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106254
2504	NC_011988	TGA	2	6	148597	148602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106254
2505	NC_011988	CAA	2	6	148660	148665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106254
2506	NC_011988	CAC	2	6	148687	148692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106254
2507	NC_011988	ATC	2	6	148764	148769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106254
2508	NC_011988	GGTG	2	8	148774	148781	0 %	25 %	75 %	0 %	222106254
2509	NC_011988	ATC	2	6	148796	148801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106254
2510	NC_011988	TGA	2	6	148840	148845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106254
2511	NC_011988	CCGT	2	8	148873	148880	0 %	25 %	25 %	50 %	222106254
2512	NC_011988	GCAA	2	8	148893	148900	50 %	0 %	25 %	25 %	222106254
2513	NC_011988	GCG	2	6	148961	148966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106254
2514	NC_011988	GCT	2	6	148972	148977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106254
2515	NC_011988	GCA	2	6	148992	148997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106254
2516	NC_011988	CCA	2	6	149097	149102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106254
2517	NC_011988	TAC	2	6	149231	149236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106254
2518	NC_011988	CCG	2	6	149252	149257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106254
2519	NC_011988	CATG	2	8	149261	149268	25 %	25 %	25 %	25 %	222106254
2520	NC_011988	CAC	2	6	149302	149307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106255
2521	NC_011988	GGC	2	6	149329	149334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106255
2522	NC_011988	CGG	2	6	149372	149377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106255
2523	NC_011988	GCA	2	6	149456	149461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106255
2524	NC_011988	GCG	2	6	149476	149481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106255
2525	NC_011988	CGG	2	6	149551	149556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106255
2526	NC_011988	ATC	2	6	149597	149602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106255
2527	NC_011988	GCA	2	6	149606	149611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106255
2528	NC_011988	TCC	2	6	149615	149620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106255
2529	NC_011988	TGG	2	6	149652	149657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106255
2530	NC_011988	CT	3	6	149669	149674	0 %	50 %	0 %	50 %	222106255
2531	NC_011988	ATT	2	6	149697	149702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106255
2532	NC_011988	GCT	2	6	149806	149811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106255
2533	NC_011988	CAT	2	6	149857	149862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106255
2534	NC_011988	GTTGCC	2	12	149864	149875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106255
2535	NC_011988	ATCG	2	8	149909	149916	25 %	25 %	25 %	25 %	222106255
2536	NC_011988	TGG	2	6	149937	149942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106255
2537	NC_011988	CCT	2	6	149952	149957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106255
2538	NC_011988	GGT	2	6	150022	150027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106255
2539	NC_011988	ATG	2	6	150033	150038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106255
2540	NC_011988	ATC	2	6	150080	150085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106255
2541	NC_011988	CA	3	6	150201	150206	50 %	0 %	0 %	50 %	222106255
2542	NC_011988	CCAT	2	8	150207	150214	25 %	25 %	0 %	50 %	222106255
2543	NC_011988	GCC	2	6	150245	150250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106255
2544	NC_011988	GCC	2	6	150380	150385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106255
2545	NC_011988	TGG	2	6	150403	150408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106255
2546	NC_011988	GC	3	6	150410	150415	0 %	0 %	50 %	50 %	222106255
2547	NC_011988	GCC	2	6	150535	150540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106255
2548	NC_011988	CGC	2	6	150676	150681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106256
2549	NC_011988	CAA	2	6	150819	150824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106256
2550	NC_011988	CAG	2	6	150836	150841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106256
2551	NC_011988	CCA	2	6	150914	150919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106256
2552	NC_011988	GGCT	2	8	150921	150928	0 %	25 %	50 %	25 %	222106256
2553	NC_011988	CGG	2	6	150957	150962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106256
2554	NC_011988	GCT	2	6	150978	150983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106256
2555	NC_011988	TCT	2	6	151034	151039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106256
2556	NC_011988	ATG	2	6	151052	151057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106256
2557	NC_011988	GAA	2	6	151072	151077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106256
2558	NC_011988	CCG	2	6	151079	151084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106256
2559	NC_011988	ATCA	2	8	151204	151211	50 %	25 %	0 %	25 %	222106256
2560	NC_011988	TGAT	2	8	151253	151260	25 %	50 %	25 %	0 %	222106256
2561	NC_011988	GCC	2	6	151261	151266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106256
2562	NC_011988	CAT	2	6	151284	151289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106256
2563	NC_011988	CAA	2	6	151323	151328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106256
2564	NC_011988	CGG	2	6	151371	151376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106256
2565	NC_011988	GAAG	2	8	151401	151408	50 %	0 %	50 %	0 %	222106256
2566	NC_011988	GC	3	6	151419	151424	0 %	0 %	50 %	50 %	222106256
2567	NC_011988	TGAA	2	8	151433	151440	50 %	25 %	25 %	0 %	222106256
2568	NC_011988	CCG	2	6	151449	151454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106256
2569	NC_011988	CG	3	6	151502	151507	0 %	0 %	50 %	50 %	222106256
2570	NC_011988	TC	3	6	151575	151580	0 %	50 %	0 %	50 %	222106256
2571	NC_011988	GAA	2	6	151591	151596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106256
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2573	NC_011988	GCC	2	6	151742	151747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106257
2574	NC_011988	CCG	2	6	151819	151824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106257
2575	NC_011988	GTG	2	6	151866	151871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106257
2576	NC_011988	GGCA	2	8	151877	151884	25 %	0 %	50 %	25 %	222106257
2577	NC_011988	GCCGG	2	10	151988	151997	0 %	0 %	60 %	40 %	222106257
2578	NC_011988	GCC	2	6	152027	152032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106257
2579	NC_011988	TCGGGA	2	12	152056	152067	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222106257
2580	NC_011988	TG	3	6	152117	152122	0 %	50 %	50 %	0 %	222106257
2581	NC_011988	TCT	2	6	152133	152138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106257
2582	NC_011988	CAG	2	6	152171	152176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106257
2583	NC_011988	GCC	3	9	152210	152218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106257
2584	NC_011988	TGA	2	6	152245	152250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106257
2585	NC_011988	CAG	2	6	152304	152309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106257
2586	NC_011988	GTG	2	6	152339	152344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106257
2587	NC_011988	CTG	3	9	152386	152394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106257
2588	NC_011988	ACC	2	6	152410	152415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106257
2589	NC_011988	TGG	2	6	152437	152442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106257
2590	NC_011988	AGC	2	6	152490	152495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106257
2591	NC_011988	GCATAG	2	12	152502	152513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222106257
2592	NC_011988	CGCC	2	8	152514	152521	0 %	0 %	25 %	75 %	222106257
2593	NC_011988	CATCCA	2	12	152551	152562	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222106257
2594	NC_011988	GGC	2	6	152582	152587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106257
2595	NC_011988	CAG	2	6	152741	152746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106257
2596	NC_011988	GATG	2	8	152764	152771	25 %	25 %	50 %	0 %	222106257
2597	NC_011988	ATG	2	6	152885	152890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106257
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2599	NC_011988	GGC	2	6	153059	153064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106258
2600	NC_011988	TGC	2	6	153093	153098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106258
2601	NC_011988	TTG	2	6	153120	153125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106258
2602	NC_011988	ATC	2	6	153134	153139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106258
2603	NC_011988	CACC	2	8	153226	153233	25 %	0 %	0 %	75 %	222106258
2604	NC_011988	GCA	2	6	153237	153242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106258
2605	NC_011988	TGG	2	6	153244	153249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106258
2606	NC_011988	ATC	2	6	153282	153287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106258
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2608	NC_011988	GC	3	6	153423	153428	0 %	0 %	50 %	50 %	222106258
2609	NC_011988	TGGTC	2	10	153439	153448	0 %	40 %	40 %	20 %	222106258
2610	NC_011988	GCG	2	6	153542	153547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106258
2611	NC_011988	GCG	2	6	153553	153558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106258
2612	NC_011988	ATAG	2	8	153572	153579	50 %	25 %	25 %	0 %	222106258
2613	NC_011988	CAT	2	6	153691	153696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106258
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2615	NC_011988	TTG	2	6	153765	153770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106258
2616	NC_011988	ATG	3	9	153771	153779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106258
2617	NC_011988	CAT	2	6	153826	153831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106258
2618	NC_011988	GCCT	2	8	153893	153900	0 %	25 %	25 %	50 %	222106258
2619	NC_011988	CAC	2	6	153919	153924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106258
2620	NC_011988	GC	3	6	153979	153984	0 %	0 %	50 %	50 %	222106258
2621	NC_011988	GTG	2	6	154008	154013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106258
2622	NC_011988	AGA	2	6	154032	154037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106258
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2624	NC_011988	ATG	2	6	154240	154245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106259
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2626	NC_011988	CAG	2	6	154317	154322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106259
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2634	NC_011988	AGA	2	6	154699	154704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106259
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2742	NC_011988	GCA	2	6	160649	160654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106263
2743	NC_011988	CCG	2	6	160657	160662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106263
2744	NC_011988	GCT	3	9	160694	160702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106263
2745	NC_011988	CTG	2	6	160743	160748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106263
2746	NC_011988	CAA	2	6	160751	160756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106263
2747	NC_011988	GA	3	6	160878	160883	50 %	0 %	50 %	0 %	222106264
2748	NC_011988	CGC	3	9	161107	161115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106264
2749	NC_011988	TCAT	2	8	161140	161147	25 %	50 %	0 %	25 %	222106264
2750	NC_011988	GC	3	6	161240	161245	0 %	0 %	50 %	50 %	222106264
2751	NC_011988	CAGGCG	2	12	161256	161267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222106264
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2762	NC_011988	CTG	2	6	161667	161672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106264
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2766	NC_011988	ATCT	2	8	162144	162151	25 %	50 %	0 %	25 %	222106264
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2770	NC_011988	CGG	2	6	162319	162324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106264
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2774	NC_011988	GC	3	6	162496	162501	0 %	0 %	50 %	50 %	222106265
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2778	NC_011988	CTT	3	9	162600	162608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106265
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2781	NC_011988	GGGA	2	8	162714	162721	25 %	0 %	75 %	0 %	222106265
2782	NC_011988	GCC	2	6	162736	162741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106265
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2847	NC_011988	A	6	6	165443	165448	100 %	0 %	0 %	0 %	222106267
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2850	NC_011988	TGG	2	6	165839	165844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106268
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2852	NC_011988	GC	3	6	166028	166033	0 %	0 %	50 %	50 %	222106268
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2856	NC_011988	CGA	2	6	166142	166147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106268
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2858	NC_011988	CAA	2	6	166242	166247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106268
2859	NC_011988	GAC	2	6	166269	166274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106268
2860	NC_011988	GCAAT	2	10	166280	166289	40 %	20 %	20 %	20 %	222106268
2861	NC_011988	TGA	2	6	166355	166360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106268
2862	NC_011988	TTC	2	6	166375	166380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106268
2863	NC_011988	TCA	2	6	166385	166390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106268
2864	NC_011988	GTC	2	6	166396	166401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106268
2865	NC_011988	ATG	2	6	166455	166460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106268
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2983	NC_011988	TTGG	2	8	172124	172131	0 %	50 %	50 %	0 %	222106274
2984	NC_011988	GCT	2	6	172160	172165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106274
2985	NC_011988	AGAT	2	8	172187	172194	50 %	25 %	25 %	0 %	222106274
2986	NC_011988	CGC	2	6	172216	172221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106274
2987	NC_011988	CTG	2	6	172237	172242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106274
2988	NC_011988	CAT	2	6	172308	172313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106274
2989	NC_011988	GCG	2	6	172507	172512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106274
2990	NC_011988	GCC	2	6	172531	172536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106274
2991	NC_011988	AGC	2	6	172580	172585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106274
2992	NC_011988	GCC	2	6	172721	172726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106274
2993	NC_011988	GCC	2	6	172762	172767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106274
2994	NC_011988	TGCC	2	8	172821	172828	0 %	25 %	25 %	50 %	222106274
2995	NC_011988	CAG	2	6	172894	172899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106274
2996	NC_011988	CTT	3	9	173082	173090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106275
2997	NC_011988	CAT	2	6	173156	173161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106275
2998	NC_011988	GGT	2	6	173259	173264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106275
2999	NC_011988	AG	3	6	173303	173308	50 %	0 %	50 %	0 %	222106275
3000	NC_011988	CGC	2	6	173324	173329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106275

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